引物设计原则(引物设计原则和注意事项)
大家好,关于引物设计原则很多朋友都还不太明白,不知道是什么意思,那么今天我就来为大家分享一下关于引物设计原则和注意事项的相关知识,文章篇幅可能较长,还望大家耐心阅读,希望本篇文章对各位有所帮助!
1引物设计原则是什么?
引物自身及引物之间不应存在互补序列。引物5′端和中间△G值应该相对较高,而3′端△G值较低。引物的5′端可以修饰,而3′端不可修饰。扩增产物的单链不能形成二级结构。1引物应具有特异性。
引物设计有 3 条基本原则:首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构,再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应(即错配)。
引物设计原则是:引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp。引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近。
2引物设计原则
1、引物设计有3条基本原则:引物与模板的序列要紧密互补。引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构。再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应(即错配)。
2、引物设计有 3 条基本原则:首先引物与模板的序列要紧密互补,其次引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构,再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应(即错配)。
3、引物设计原则是:引物长度一般为15-30bp,常用的为18-27bp,但不能大于38bp。引物GC含量一般为40%-60%,以45-55%为宜,上下游引物GC含量和Tm值要保持接近。
4、引物设计原则 长度:15—30bp,其有效长度[Ln=2(G十C)十(A十T)]一般不大于38,否则PCR的最适延伸温度会超过Taq酶的最佳作用温度(74度),从而降低产物的特异性。
3【科研】PCR引物设计原则
1、遵循原则如下: 引物长度:引物的最佳长度为24或25个碱基左右。但是如果需要调整Tm值,引物的长度可以控制在21至28个碱基之间。当扩增≥10 kb长片段时,25-35个碱基之间的引物可以提供更好的结果。
2、引物自身及引物之间不应存在互补序列。引物5′端和中间△G值应该相对较高,而3′端△G值较低。引物的5′端可以修饰,而3′端不可修饰。扩增产物的单链不能形成二级结构。1引物应具有特异性。
3、引物设计有3条基本原则:引物与模板的序列要紧密互补。引物与引物之间避免形成稳定的二聚体或发夹结构。再次引物不能在模板的非目的位点引发DNA聚合反应(即错配)。
4、PCR引物设计的11条黄金法则 引物最好在模板cDNA的保守区内设计。 DNA序列的保守区是通过物种间相似序列的比较确定的。
5、引物设计的原则是:引物最好在模板cDNA的保守区内设计。引物长度一般在15-30碱基之间。引物GC含量在40%-60%之间,Tm值最好接近72℃。引物3′端要避开密码子的第3位。
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